Accompagnement d'une étudiante en Master bio-informatique pour la réalisation de projet de parsing de fichier SAM en python

Utiliser la version 3.6 de python pour lancer le projet

sudo apt-get install python3.6

Affichage d'une aide à l'utilisation

python3 sam-parser.py --help

Utilisation: python3 sam-parser.py [FICHIER] [METHOD]
[FICHIER] fichier de type SAM
[METHOD] la méthode utilisé doit être 'flag' or 'cigar'

python3 sam-parser.py data/mapping.sam cigar

python3 sam-parser.py data/mapping.sam flag