noSoloDatos Del 5 de marzo al 5 de junio de 2020

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  • Datos globales

Minería de los datos públicos oficiales durante las primeras fases de la pandemia de Coronavirus COVID-19, recolectados diariamente para su proceso y visualización en noSoloDatos.

🆕 Liberado completamente el código - RMarkdown/HTML. 🎄- Navidades 2022.

• Seguimiento del COVID-19. Esta página recopila los datos oficiales principales (casos confirmados, fallecidos, hospitalizados, UCIs…) por CCAA entre el 5 de marzo de 2020 y el 5 de junio de 2020. [Problemas en el enlace original por conflictos entre librerías tal como se procesan en Hugo / Netlify, me obliga a re-publicar la página en Amazon S3]. Mantengo el despliegue en Amazon a modo de backup: Seguimiento del COVID-19]
• Series temporales COVID-19. Esta página muestra de una manera accesible los datos de casos confirmados, fallecidos y recuperados en el mundo, proporcionados por el Centro de Ciencia de Ingeniería y Sistemas de la Universidad Johns Hopkins (repo).
• Estudio de Seroprevalencia ENE-Covid19. Ronda 1 - Ronda 2. Esta página recopila los resultados del “Estudio Nacional de sero-Epidemiología de la infección por SARS-CoV-2 en España (ENE-Covid19)” del Instituto de Salud Carlos III (página oficial del estudio). [Trabajo en proceso]
• Cronología del SARS-CoV-2. Cronología de los principales hitos de la pandemia. [Trabajo en proceso]

En este repositorio (COVID-19/data/) se pueden descargar y/o consultar los siguientes archivos:

• PDFs: Todos los informes diarios originales publicados por el Ministerio de Sanidad:
  • Actualizacion_xx_COVID-19.pdf > Desde la actualización 37 correspondiente al 5 de marzo a la 99 del 8 de mayo.
  • Actualizacion_xxx_COVID-19.pdf > Desde la actualización 100 correspondiente al 9 de mayo a la última actualización disponible.
• CSVs: Los datos de incidencia por Comunidades Autónomas extraídos de los PDFs originales descritos en el punto anterior.
  • El nombre de los archivos sigue el siguiente formato: coviDDMM.csv
• Serie temporal: Este archivo se pude descargar o consultar en COVID-19/data/st.csv. Son los datos extraídos de las tablas anteriores, o más apropiadamente la compilación de todos ellos en un solo fichero (st.csv), que podría no estar en el formato ideal para su tratamiento dependiendo de la configuración de tu entorno de software. Por ejemplo para transformar el archivo a un formato amigable para procesar datos de series de tiempo en R se puede utilizar el siguiente código:

sturl <- "https://raw.githubusercontent.com/Eclectikus/COVID-19/master/data/st.csv"
stt <- read.csv(sturl, encoding = "UTF-8")

# Convierte en numéricos los valores del IA (importados originalmente como texto):
stt$IA <- as.numeric(as.character(stt$IA))

# Cambia la columna de fechas (originalmente texto) al formato de fecha utilizado por R:
stt$Fecha <- as.Date(as.character(stt$Fecha), "%d/%m/%y")

Estudio Nacional de sero-Epidemiología de la infección por SARS-CoV-2 en España (ENE-Covid19)

• PDFs originales
  • Ronda 1 (13 de mayo) > ene_covid19_inf_pre.pdf
  • Ronda 2 (3 de junio) > ene_covid19_inf_pre2.pdf
• Estudio de seroprevalencia ENE-Covid19: Datos obtenidos del repositorio de Datadista:
  • Ronda 1 (13 de mayo de 2020) > COVID-19/data/prevalencia1.csv
  • Ronda 1 (Act. 3 de junio de 2020) > COVID-19/data/prevalencia1_2.csv
  • Ronda 2 (3 de junio de 2020) > COVID-19/data/prevalencia2_1.csv

Los Mapas utilizados (en formato geojson) pueden ser consultados o descargados en el directorio COVID-19/map/.

• Comunidades Autónomas: COVID-19/map/ccaa.geojson.
  • La codificación de la toponimia para las CCAA se puede consultar en COVID-19/map/codifCCAAgeojson.csv.
• Provincias: COVID-19/map/prov.geojson.
  • La codificación de la toponimia para las provincias se puede consultar en COVID-19/map/ codifPROVgeojson.csv. Aunque se utilizan los topónimos en castellano, la nomenclatura en las lenguas cooficiales se incluye también en el fichero geojson.

Para consultar las series temporales proporcionadas por el Centro de Ciencia de Ingeniería y Sistemas de la Universidad Johns Hopkins visita este otro repositorio y/o esta página.