RoboTA-SynbioCloudLab 是一个基于 Next.js 构建的合成生物学虚拟实验室平台，提供代码执行、实验分析和可视化功能。

• 🧪 虚拟实验室环境
• 📝 支持 Python 代码执行
• 🤖 集成 Opentrons 协议分析
• 📊 实验数据可视化
• 💬 AI 辅助实验设计
• 🌐 实时实验分析

• 修复前端路由 404 错误:
  • 问题: 当 ProtoFlow 应用部署在类似 /protoflow 的子路径下时，访问如 /protoflow/<id>/timeline 的前端路由会导致 404 错误。
  • 原因: React Router 的 createBrowserRouter 默认配置的路由是基于应用根路径的，没有考虑到 /protoflow 这个基础路径。
  • 解决方案: 在 opentronsedge/protoflow/frontend/src/main.jsx 文件中，向 createBrowserRouter 配置添加了 basename: '/protoflow' 选项。
  • 提交历史:
    • "解决ProtoFlow前端在子路径部署时的404错误，并添加ProtoFlow模块的README文档"
    • "添加.gitignore和ProtoFlow文档说明"
    • "更新ProtoFlow前端代码和配置"
    • "更新虚拟实验室页面"
    • "更新ProtoFlow后端应用"

• 创建了 ProtoFlow 模块专用的 README.md 文件，详细说明了项目结构和最近的修复
• 更新了虚拟实验室页面，支持 ProtoFlow 协议分析
• 优化了 ProtoFlow 后端应用，提高了 API 稳定性
• 更新了前端依赖，解决了版本兼容问题
• 添加了 /temp 目录到 .gitignore 文件，优化版本控制

• 前端框架: Next.js 14
• UI 组件: shadcn/ui
• 代码编辑器: Monaco Editor
• 样式: Tailwind CSS
• 后端: Python FastAPI/Flask

• Node.js 18+
• Python 3.9+
• Opentrons Python 库及依赖

本项目有两种运行模式：1) 仅运行虚拟实验室和 ProtoFlow 协议分析器，2) 运行完整的 RoboTA-SynbioCloudLab 平台。

# 主项目前端依赖
cd ALLrobotaWEB
npm install

# ProtoFlow 前端依赖
cd opentronsedge/protoflow/frontend
npm install

# ProtoFlow 后端依赖
cd opentronsedge/protoflow/backend
python -m venv protoflow_env
source protoflow_env/bin/activate  # Windows: protoflow_env\Scripts\activate
pip install fastapi uvicorn opentrons

ProtoFlow 组件需要按以下顺序启动：

1. ProtoFlow 后端:

cd opentronsedge/protoflow/backend
# 激活虚拟环境 (如果使用)
source protoflow_env/bin/activate  # Windows: protoflow_env\Scripts\activate
# 启动后端服务
python app.py

后端服务将在 http://localhost:8000 上运行

2. ProtoFlow 前端:

cd opentronsedge/protoflow/frontend
npm run dev

前端服务将在 http://localhost:3001 上运行

完成后，你可以访问 http://localhost:3001 来使用 ProtoFlow 协议分析器。